Клещевые флавивирусы Кемеровской области
Аннотация
Выпускная квалификационная работа содержит 62 страницы, 3 таблицы, 14 иллюстраций, 65 использованных источников.
ВИРУС КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОМСКАЯ ГЕМОРРАГИЧЕСКАЯ ЛИХОРАДКА, СУБТИП, ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ЛИНИЯ, ЭВОЛЮЦИЯ ВКЭ, КЛАСТЕРОН, КЛЕЩИ, ПРИРОДНЫЙ ОЧАГ, ФЛАВИВИРУСЫ
Цель настоящего исследования - определение видового разнообразия клещевых флавивирусов, а также структуры их популяции в Кемеровской области.
Методы исследования включают в себя молекулярно-генетические (экстракция генетического материала, обратная транскрипция, ПЦР в реальном времени, классическая ПЦР, горизонтальный электрофорез в агарозном геле, секвенирование по Сенгеру), филогенетический анализ (с помощью MEGA11, Phylogenetic Network Software).
В результате работы был исследован видовой состав клещей, собранных в окрестностях д. Денисово. Установлено видовое разнообразие клещевых флавивирусов: вирус клещевого энцефалита и вирус омской геморрагической лихорадки, впервые найденный на данной территории. С помощью филогенетического анализа исследовано генетическое разнообразие ВКЭ и ВОГЛ, а также их кластеронная структура. Были изучены штаммы Балтийской филогенетической линии, также ранее не зафиксированные в этой местности.
Практическая значимость работы заключается в получении новой информации о распространении ВОГЛ, а также в расширении ареала Балтийской филогенетической линии в восточном направлении. Данная работа может служить хорошим примером применения стратегии детального изучения природного очага для понимания его популяционной структуры и эволюции с целью оценки эпидемиологической обстановки в стране и принятию мер по контролю, прогнозу, борьбе и профилактике флавивирусных инфекций.
ВИРУС КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОМСКАЯ ГЕМОРРАГИЧЕСКАЯ ЛИХОРАДКА, СУБТИП, ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ЛИНИЯ, ЭВОЛЮЦИЯ ВКЭ, КЛАСТЕРОН, КЛЕЩИ, ПРИРОДНЫЙ ОЧАГ, ФЛАВИВИРУСЫ
Цель настоящего исследования - определение видового разнообразия клещевых флавивирусов, а также структуры их популяции в Кемеровской области.
Методы исследования включают в себя молекулярно-генетические (экстракция генетического материала, обратная транскрипция, ПЦР в реальном времени, классическая ПЦР, горизонтальный электрофорез в агарозном геле, секвенирование по Сенгеру), филогенетический анализ (с помощью MEGA11, Phylogenetic Network Software).
В результате работы был исследован видовой состав клещей, собранных в окрестностях д. Денисово. Установлено видовое разнообразие клещевых флавивирусов: вирус клещевого энцефалита и вирус омской геморрагической лихорадки, впервые найденный на данной территории. С помощью филогенетического анализа исследовано генетическое разнообразие ВКЭ и ВОГЛ, а также их кластеронная структура. Были изучены штаммы Балтийской филогенетической линии, также ранее не зафиксированные в этой местности.
Практическая значимость работы заключается в получении новой информации о распространении ВОГЛ, а также в расширении ареала Балтийской филогенетической линии в восточном направлении. Данная работа может служить хорошим примером применения стратегии детального изучения природного очага для понимания его популяционной структуры и эволюции с целью оценки эпидемиологической обстановки в стране и принятию мер по контролю, прогнозу, борьбе и профилактике флавивирусных инфекций.