Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, выделенных на территории РФ в период с 1987 по 2021 годы
Аннотация
Данные о субтиповой и филогенетической структуре штаммов ВИЧ-1, циркулирующих на территории РФ, носят региональный характер и давно не обновлялись. В данной работе была сформирована структурированная база данных последовательностей гена pol ВИЧ-1, циркулировавших на территории РФ в период с 1987 по 2021 годы с установлением региона и года получения последовательности, была выявлена их субтиповая и филогенетическая структура.
Было обнаружено 6 субтипов и 5 рекомбинантных форм: A6, B, C, D, F, G, CRF01_AE, CRF02_AG, CRF03_AB, CRF06_cpx, CRF63_02A1. При поиске ближайших родственных последовательностей за рубежом было обнаружены 50 последовательностей, имеющих генетическую идентичность с Российскими не менее чем на 97%, большинство из которых (43) приходилось на страны ближнего зарубежья.
Было обнаружено 6 субтипов и 5 рекомбинантных форм: A6, B, C, D, F, G, CRF01_AE, CRF02_AG, CRF03_AB, CRF06_cpx, CRF63_02A1. При поиске ближайших родственных последовательностей за рубежом было обнаружены 50 последовательностей, имеющих генетическую идентичность с Российскими не менее чем на 97%, большинство из которых (43) приходилось на страны ближнего зарубежья.