Анализ сетей в исследованиях сложных сообществ микроорганизмов

Аннотация

Анализ сетей – мощный инструмент исследования взаимосвязей компонентов экологических сообществ. Особую сложность для анализа взаимоотношений в сообществах микроорганизмов представляет их многокомпонентность и композиционность данных. В данной работе на основе анализа данных ДНК–метабаркодирования показано 30–40% снижение разнообразия почвенных грибов лесов в градиентах промышленного загрязнения на Южном и Среднем Урале. Эктомикоризные грибы – устойчивая к загрязнению группа. В ходе анализа сетей показана недопустимость оценки совместной встречаемости с помощью стандартных коэффициентов корреляции и необходимость использования методов, предназначенных для композиционных данных. Анализ сетей позволил оценить конкурентные взаимоотношения или разделение экологических ниш между функционально сходными группами грибов, а также взаимоотношения паразит-хозяин.
Число страниц 102. Количество рисунков 19, таблиц 10, формул 7 и приложений 5. Количество источников литературы 236, в том числе 20 русскоязычных и 216 англоязычных.
Ключевые слова: грибные сообщества, экологические сети, метабаркодинг, анализ сетей, загрязнение.