Сборка и анализ транскриптома ячменя

Аннотация

Выпускная квалификационная работа бакалавра выполнена на 51 странице, содер-жит 10 рисунков, 4 таблицы, 83 источника литературы. ТРАНСКРИПТОМ, HORDEUM VULGARE L., НАНОПОРОВОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ, ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ, ВЫДЕЛЕНИЕ РНК В работе изучались особенности нанопорового секвенирования транскриптома яч-меня обыкновенного и анализ полученных данных при помощи биоинформатических при-ложений, таких как Pychopper, minimap2, StringTie, GffCompare и Salmon. Была определен оптимальный способ обработки полученных прочтений для сохра-нения большего числа последовательностей для следующих этапов анализа, таких как из-мерение обилия транскриптов. Были собраны транскриптомы клеток трёх зон первичного листа ячменя, и проанализированы на предмет генов, которые в них экспрессируются. По-казано, что для всех образцов наибольшую долю в экспрессии занимают одинаковые тран-скрипты.