Генетическое разнообразие и филогеографическое положение водяной полевки (Linnaeus, 1758) Урала и Западной Сибири по данным последовательностей гена cyt b
Аннотация
Выпускная квалификационная работа на соискание степени бакалавра – 58 стр., 11 рис., 8 табл., 85 источников. Работа состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов и обсуждений, выводов, списка использованных источников и литературы.
ВОДЯНАЯ ПОЛЕВКА, ФИЛОГЕОГРАФИЯ, ЦИТОХРОМ B, ЭКСПАНСИЯ
Цель работы - анализ генетического разнообразия и определение филогеографического положения водяной полевки (Arvicola amphibius) Урала и Западной Сибири на основе данных последовательностей гена цитохрома b мтДНК.
Для 39 особей водяной полевки из 10 ранее неисследованных локалитетов Урала и Западной Сибири, а так же Республики Карелия выделена тотальная ДНК и секвенированы полные последовательности гена cyt b (1140 п.н.) мтДНК. Обнаружено 12 гаплотипов, каждый из которых является новым для вида. Результаты филогенетических реконструкций (метод Байесова анализа) с включением полученных нами и ранее опубликованных данных (база данных GenBank) показали принадлежность водяных полевок Урала и Западной Сибири, а также Карелии к Сибирской подгруппе Евро-Сибирской клады, выделенной ранее на основании единичных образцов из юго-восточной части ареала. Филогеографическое положение, анализ генетического разнообразия и тестов на селективную нейтральность A. amphibius исследуемых территорий свидетельствует о расселении вида по территории Восточно-Европейской равнины, Урала, Западной и Восточной Сибири в относительно недавнем прошлом, наиболее вероятно, на рубеже поздний плейстоцен - ранний голоцен.
ВОДЯНАЯ ПОЛЕВКА, ФИЛОГЕОГРАФИЯ, ЦИТОХРОМ B, ЭКСПАНСИЯ
Цель работы - анализ генетического разнообразия и определение филогеографического положения водяной полевки (Arvicola amphibius) Урала и Западной Сибири на основе данных последовательностей гена цитохрома b мтДНК.
Для 39 особей водяной полевки из 10 ранее неисследованных локалитетов Урала и Западной Сибири, а так же Республики Карелия выделена тотальная ДНК и секвенированы полные последовательности гена cyt b (1140 п.н.) мтДНК. Обнаружено 12 гаплотипов, каждый из которых является новым для вида. Результаты филогенетических реконструкций (метод Байесова анализа) с включением полученных нами и ранее опубликованных данных (база данных GenBank) показали принадлежность водяных полевок Урала и Западной Сибири, а также Карелии к Сибирской подгруппе Евро-Сибирской клады, выделенной ранее на основании единичных образцов из юго-восточной части ареала. Филогеографическое положение, анализ генетического разнообразия и тестов на селективную нейтральность A. amphibius исследуемых территорий свидетельствует о расселении вида по территории Восточно-Европейской равнины, Урала, Западной и Восточной Сибири в относительно недавнем прошлом, наиболее вероятно, на рубеже поздний плейстоцен - ранний голоцен.