ВЗАИМОВЛИЯНИЕ DPS И МЕТАБОЛИЧЕСКИХ ФАКТОРОВ ТРАНСКРИПЦИИ В РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА dps
Аннотация
Целью данной работы является оценка вовлеченности метаболических регуляторов в модуляцию экспрессии гена dps и их интерференции с белком Dps.
В ходе исследования методом обратной транскрипции с последующей ПЦР в реальном времени был проведен анализ зависимости экспрессии гена dpsв от метаболических факторов. Также проведен ряд экспериментов методом задержки ДНК-белковых комплексов в геле для оценки эффективности взаимодействия белков Dps, YjjM и ExuR с регуляторными областями генов dps, yjjM, fliA и exuR, проверено влияние гексуроновых кислот на олигомерную форму белка Dps. Проведен сравнительно-геномный анализ последовательностей регуляторной области dps у близкородственных E. coli бактерий, а также Dickeya dadantii.
Проведенное исследование позволило сделать следующие выводы: гексуроновые кислоты стимулируют образование олигомерных форм Dps более низкого порядка и мономеров, что позволило впервые зафиксировать бинарные комплексы Dpsс регуляторными областями генов dps и fliA. С регуляторной областью гена dps связываются такиe метаболические факторы транскрипции как ExuR и YjjM. Влияние ExuR на экспрессию гена dps подтверждено с помощью qRT-PCR. Присутствие в пробе белков Dps и ExuR стимулирует образование диффузных комплексов с регуляторными областями генов dps и exuR, что может говорить об их кооперативном взаимодействии.
В ходе исследования методом обратной транскрипции с последующей ПЦР в реальном времени был проведен анализ зависимости экспрессии гена dpsв от метаболических факторов. Также проведен ряд экспериментов методом задержки ДНК-белковых комплексов в геле для оценки эффективности взаимодействия белков Dps, YjjM и ExuR с регуляторными областями генов dps, yjjM, fliA и exuR, проверено влияние гексуроновых кислот на олигомерную форму белка Dps. Проведен сравнительно-геномный анализ последовательностей регуляторной области dps у близкородственных E. coli бактерий, а также Dickeya dadantii.
Проведенное исследование позволило сделать следующие выводы: гексуроновые кислоты стимулируют образование олигомерных форм Dps более низкого порядка и мономеров, что позволило впервые зафиксировать бинарные комплексы Dpsс регуляторными областями генов dps и fliA. С регуляторной областью гена dps связываются такиe метаболические факторы транскрипции как ExuR и YjjM. Влияние ExuR на экспрессию гена dps подтверждено с помощью qRT-PCR. Присутствие в пробе белков Dps и ExuR стимулирует образование диффузных комплексов с регуляторными областями генов dps и exuR, что может говорить об их кооперативном взаимодействии.